Europos Sąjungos Tarybos direktyvoje dėl laukinių gyvūnų laikymo zoologijos soduose 1999/22/EB yra pabrėžiama, kad zoologijos sodai turi stiprinti vaidmenį saugant biologinę įvairovę. Pasitelkiant zoologijos sodo darbuotojų profesionalumą ir žinias, atnaujinant fiziškai ir morališkai sunykusią materialinę ekspozicijos bazę, gali būti sėkmingai formuojamas visuomenės supratimas apie gamtos reikšmę ir jos išsaugojimo svarbą. Reikia nepamiršti, kad zoologijos sodas nėra tik gyvūnų ekspozicija – biologinės įvairovės išsaugojimas yra vienas didžiausių tikslų.
Visame pasaulyje vykstančios gyvūnų išnykimo krizės rodo, kad zoologijos sodai yra reikalingi net ir įprastoms gyvūnų rūšims. Kai kuriems gyvūnams laukinė gamta yra pavojinga dėl antropogeninių veiksnių ir gresia jų išnykimas, todėl zoologijos sodai yra bene vienintelė vieta, kur jie saugūs. Kai kurios gyvūnų rūšys laukinėje gamtoje jau yra išnykusios ir yra likę tik nelaisvėje gyvenančios jų populiacijos. Taigi, kalbant apie gyvūnų rūšių išsaugojimo svarbą – zoologijos sodo reikšmė neginčytina.
Po Lietuvos zoologijos sodo rekonstrukcijos bus laikomi tik tie laukiniai gyvūnai, kuriems reikia apsaugos. Kiekvienas gyvūnas, kuris bus laikomas zoologijos sode, „neš žinutę visuomenei“ – reikia tausoti aplinką, didinti žmonių sąmojingumą, mažinti vartojimą, kitaip zoologijos sodai bus vienintelė vieta pasaulyje išvysti kai kurias gyvūnų rūšis. Iš esmės pakeitus Lietuvos zoologijos sodo infrastruktūrą, maksimaliai užtikrinus tinkamas sąlygas gyvūnų auginimui ir laikymui, jis turėtų tapti visuomenės kultūros, švietimo ir poilsio centru.
